Ekologi ekosistem berasal dari kata dasar ekologi.
Cabang ekologi yang berkaitan dengan analisis ekosistem apabila dipandang dari sudut struktural dan fungsional, termasuk hubungan antara biotik dan abiotik.
Menurut Kamus Besar Bahasa Indonesia (KBBI), arti ekologi ekosistem adalah cabang ekologi yang berkaitan dengan analisis ekosistem apabila dipandang dari sudut struktural dan fungsional, termasuk hubungan antara biotik dan abiotik.